在全世界的大學正風起雲湧地推動全球化之際，國內大學亦須迎向競爭，財團法人高等教育評鑑中心基金會(以下簡稱本會) 2006年開始推動「大學校院科學期刊論文質量統計分析」實施計畫。
「科學期刊論文質量統計分析」實施計畫敦請各領域與學門召集人就計畫方向、執行內容與如何正確解讀統計數據等，分別於三次「領域與學門召集人會議」中徵集與會召集人的意見，希冀整個計畫方向、內容與統計分析，可以更完整周延。期刊論文統計分析之指標設計，亦經邀請科學與書目計量專業學者，召開「期刊論文統計分析指標諮詢會議」後，方定案施行，預期每年提供統計結果。
2007年起，「科學期刊論文質量統計分析」進行全面國內大專校院20個學門Web of Science (簡稱WOS)論文統計，20個學門論文統計結果皆屬自然科學與工程類學門；人文與社會領域方面，本會將俟機結合人文社會領域建置資料庫的能量，進行期刊論文統計工作。
大專校院之WOS論文統計分析，希冀深度瞭解各學門中大專校院的論文發表情況，於2006年中發函大專校院，敬請各校提供過去十年曾使用之校名英文全稱與簡稱，感謝148所大專校院回函提供寶貴資訊，使得WOS資料庫之國內大專校院五年來所屬期刊論文質與量方面的統計分析得以順利進行；WOS論文統計分析應包含那些學門，而WOS兩百多個學科如何對應到學門等，除參酌國科會、ESI資料庫的分類外，各領域與學門召集人亦於三次「召集人會議」中給予寶貴的意見，本網站進行20個學門論文統計，希望盡量符合國情，並加入領域與學門召集人之精闢見解；然而「學門」的分野與「系所」不同，A系所的研究結果可能投稿到B學門期刊中，「學門」期刊論文統計含蓋那些WOS學科，請參酌各「學門」論文統計表的備註欄，本網站統計結果希望能反應學校於各學門的整體研究能量，超越系所的畛域。
WOS資料庫之國內大專校院五個出版年所屬之20個學門論文之檢索與統計工作艱鉅，委請華藝數位股份有限公司協助進行。2007年與2008年之網頁發表涵蓋廣泛的論文統計，研究論文(article)約佔九成，其他如簡訊期刊(letter)、會議摘要(meeting abstracts)、研討會論文(proceedings paper) 及評論(review)等亦涵蓋在內，統計分析指標含論文發表數、被引次數、平均被引次數、期刊影響係數(IF) 值總積分與平均積分等五項；論文發表數、被引次數、期刊影響係數(IF) 值總積分等指標皆公布表現在各學門前15名的學校，平均被引次數與IF平均積分先分別取總被引次數與IF總積分各學門前15名的學校，再分別依平均被引次數與IF平均積分排序；若有前15名學校的論文發表總篇數相同，則以總被引用次數高者順序為先；反之亦然，若有前15名學校的論文發表總被引用次數相同，則以總篇數高者順序為先。
本網站2009年起新增h指數統計分析指標，此指標最主要的特色，是同時考慮到論文的質與量兩個面向，h指數表現優異的單位，必是質與量能夠兼顧的；另一特點是，此指標能夠避免極值影響，若單位僅發表少數被引用次數較高的論文，h指數不會受到這些少數論文的影響而提高表現。因此，2009&2010年之網頁發表國內大專校院五個出版年所屬之20個學門研究論文(article)之統計分析指標共六項，包含論文發表數、被引次數、平均被引次數、h指數、期刊影響係數(IF) 值總積分與平均積分等六項，皆公布表現在各學門前15名的學校，平均被引次數與IF平均積分先分別取總被引次數與IF總積分各學門前15名的學校，再分別依平均被引次數與IF平均積分排序；若有前15名學校的論文發表總篇數相同，則以總被引用次數高者順序為先；反之亦然，若有前15名學校的論文發表總被引用次數相同，則以總篇數高者順序為先；另，若學校的h指數相同，先依總篇數高者排序，若再相同，則以總被引用次數高者順序為先。
2008年數據反應出20個學門中有進入前15名學校較2007年增加四個學校，同樣是統計五個出版年20個學門論文分析指標，2008年(統計2003年至2007年間)學校在論文發表數、被引次數、期刊影響係數(IF) 值總積分等幾乎都比2007年(統計2002年至2006年間)有明顯的成長； 2009年則較2008年再增加兩個進入前15名學校，2010年再增加一校，共有61所大專校院在20個學門任一指標進入前15名，同樣是統計五個出版年研究論文質量指標，2010年(統計2005年至2009年間)學校在h指數、論文發表數、被引次數、期刊影響係數(IF) 值總積分等幾乎都比2009年(統計2004年至2008年間)有明顯的成長；希望透過這個績效統計的平臺，讓學校的努力被注意到。
本網站2010年之網頁另提供近五年學校發表收錄於SCIE、(SSCI+A&HCI)期刊論文總篇數、期刊論文總被引次數、平均被引次數等統計數據，可於「前15大依學校選項」點選學校名稱進行查詢；大專校院進入20個學門中任一指標達國內前15名可在「前15大依學校選項」中查詢到學校名稱，點選進入則可了解學校在20個學門六項指標進入前15名的情形，與近五年學校發表收錄於SCIE、(SSCI+A&HCI)期刊論文總篇數、期刊論文總被引次數、平均被引次數等統計數據。
高等教育良寙，攸關國家競爭力，故先進國家紛紛致力於高等教育改革，除進行系統性評鑑外，更積極推動高等教育績效責任，透過績效報告提升外界對大學績效的了解；本會辦理大學校院績效統計分析工作，希望達到拔尖與鼓勵的效果，進行WOS資料庫之國內大專校院五年來所屬之20個學門論文質與量方面的統計分析，希冀能以提供統計數據的方式，反應高等教育學術研究績效。
致謝:
1.感謝各領域與學門召集人－王國明教授、伍焜玉教授、李德財教授、吳茂昆教授、林長壽教授、林聖賢教授、林秋榮教授、周昌弘教授、馬哲儒教授、陳維昭教授、陳俊雄教授、陳正宏教授、陳舜田教授、陳力俊教授、萬其超教授、廖俊臣教授、廖運範教授、顏鴻森教授、蘇仲卿教授，就WOS兩百多個學科如何對應到學門給予寶貴的意見；感謝魏哲和教授主持多次會議，整合各領域與學門召集人就計畫方向、執行內容與如何正確解讀統計數據等提供之嚴謹思維。
2.感謝148所大學校院提供過去十年曾使用之校名英文全稱與簡稱，本會績效統計組據以整理所有大專校院詳細之權威控制，並確認WOS資料庫之國內大學五年來所屬期刊論文質與量方面的統計分析結果之正確性。
3.期刊論文統計分析之指標設計方面，感謝科學與書目計量專業學者－王梅玲教授、黃慕萱教授、蔡明月教授、賴鼎銘教授、羅於陵組長(洪文琪代)，於「期刊論文統計分析指標諮詢會議」提供周延思維。
4.感謝華藝數位股份有限公司協助進行WOS資料庫之國內大學五年來所屬之20個學門論文之檢索與統計。
5.感謝元威資訊科技股份有限公司協助建置網頁。
6.感謝教育部之經費支持。