本網站2009年之網頁發表Web of Science資料庫之國內大專院校2004年至2008年來所屬之20個學門研究論文(article)質與量方面六項指標的統計結果，六項指標涵蓋論文發表數、被引次數、平均被引次數、期刊影響係數(IF) 總積分與平均積分外，2009年新增H指數之統計指標；本網站2007&2008年之網頁發表涵蓋廣泛的論文統計，研究論文(article)約佔九成，其他如簡訊期刊(letter)、會議摘要(meeting abstracts)、研討會論文(proceedings paper) 及評論(review)等亦涵蓋在內；2009年之網頁發表則僅計算研究論文(article)部份，希冀能以提供統計數據的方式，反應高等教育學術研究績效。
 

　　自1963 年以來，美國科學資訊研究所(Institute for Scientific Information，以下簡稱ISI) 出版各種形式的引文索引資料庫，包括光碟、紙本及線上資料庫，提供研究資訊。1997 年推出的Web of Science 讓使用者透過Internet 或Intranet 更方便地檢索引文索引。
 

　　ISI 的引文索引資料庫(citation indexes)資料庫中收錄每個專業領域中具影響力的期刊。除了發表在收錄期刊中的文章外，ISI 也收錄了其他個別的文章。另外，ISI 亦收錄多種形式的文獻，包括簡訊期刊(letter)、會議摘要(meeting abstracts)、研討會論文(Proceedings Paper) 及評論(review)等等。
 

　　Web of Science(簡稱WOS)有三個引文索引資料庫每週更新，分別是《科學引文索引資料庫》的延伸版(Science Citation Index Expanded，以下簡稱SCIE)、《社會科學引文索引資料庫》(Social Sciences Citation Index，以下簡稱SSCI)與《人文與藝術引文索引資料庫》(Arts & Humanities Citation Index，以下簡稱A&HCI)，本網站所統計的論文來自於SCIE、 SSCI等兩個子資料庫，共約萬種期刊，表一為收錄情形。

表一 WOS收錄期刊數量與所屬學科種類

註：資料來源為ISI網站所公布。http://scientific.thomson.com/mjl/ (2009/11/4)

　　期刊引用報告(Journal Citation Report，以下簡稱JCR)是ISI所建置之網際網路版期刊引用文獻評比統計資料庫系統。本資料庫特有之影響係數 (Impact Factor，以下簡稱IF)可反應出某一期刊在前兩年度之平均學術影響力；影響係數(IF)之定義為該期刊前兩年所出版的文獻於當年被其他文章引用次數總和的平均數，例如某期刊2006 及2007 年共出版301 篇文章，而在2008 年總共被引用612 次，則Impact Factor為612÷301 ＝2.03 。不同學門的期刊影響係數(IF) 值會有高低差距的情形，因此分學門來統計是必須的。
 

　　本網站2009年之網頁發表20個學門研究論文(article)統計結果皆屬自然科學與工程類學門，20個學門包含物理、數學、化學、地球科學、資訊、材料科學、化工、機械、電機 、土木、臨床醫學、免疫&微生物學、分子生物學＆遺傳學、神經科學與行為學、藥理與毒理學、精神病學/心理學、植物與動物科學、生物學、生態/環境學、農業科學學門等；研究論文(article)皆檢索自Web of Science 下的SCIE與SSCI，「學門」研究論文(article)統計含蓋那些WOS學科，請參酌各「學門」論文統計表的備註欄，本網站統計結果希望能反應學校於各學門的整體研究能量，超越系所的畛域。
 

　　本網站2009年之網頁發表國內大專院校五個出版年所屬之20個學門研究論文(article)之統計分析指標共六項，包含論文發表數、被引次數、平均被引次數、H指數、期刊影響係數(IF) 值總積分與平均積分等六項，皆公布表現在各學門前15名的學校，平均被引次數與IF平均積分先分別取總被引次數與IF總積分各學門前15名的學校，再分別依平均被引次數與IF平均積分排序；若有前15名學校的論文發表總篇數相同，則以總被引用次數高者順序為先；反之亦然，若有前15名學校的論文發表總被引用次數相同，則以總篇數高者順序為先；另，若學校的H指數相同，先依總篇數高者排序，若再相同，則以總被引用次數高者順序為先。2009年統計研究論文(article)發表數等六項指標之下載與檢索日期為2009年9月14日。
 

　　本網站2009年之網頁發表之論文數係指在Web of Science之SCIE及SSCI資料庫收錄期刊範圍及收錄時間範圍內，學校於各學門所發表之研究論文(article)發表總數。2009年各學校研究論文總數之計算時間限制於2004年至2008年，且為實際出版年，個別計算各校五年內各學門之研究論文總數。論文被引次數係指在Web of Science之SCIE及SSCI資料庫收錄期刊範圍及收錄時間範圍內，學校於各學門所發表研究論文(article)之被引次數，2009年論文被引次數為個別計算各校五年內各學門於2004年至2008年間(實際出版年)發表研究論文(article)至檢索日(2009年9月14日)間，被其他Web of Science收錄文章所引用之次數。論文平均被引次數係指在Web of Science之SCIE及SSCI資料庫收錄期刊範圍及收錄時間範圍內，一學校發表研究論文(article)之總被引次數除以該學校所發表之研究論文(article)總數；2009年論文平均被引次數乃個別計算學校於2004年至2008年間(實際出版年)之研究論文(article)總被引次數除以五年之總研究論文(article)數，即五年內每篇研究論文(article)平均被引用之次數。
 

　　H指數定義為學校於某學門2004年至2008年間發表所有Np篇研究論文(article)中依被引次數由高至低排序，有h篇研究論文(article)至少被引用h次以上，剩下的Np-h篇研究論文(article)中每篇被引的次數小於或等於h次。
 

　　假設某學門含A、B、C、…等期刊，某學校發表數量以X、Y、Z、…等表示，IF值權重總積分統計方式請見表二：

表二、IF總積分統計方式

註：如若有IF值發生’missing data’時，則以2004-2008年的IF平均值取代之。

　　IF值平均積分為學校發表研究論文(article)之平均IF值，以IF值權重總積分結果除以總篇數（不含發表於JCR並未公布期刊IF值之論文）即為學校之期刊影響係數(IF)平均積分。
 

　　研究指標（包含論文發表總數、影響力等），乃是瞭解學術研究表現的重要數據之一。就「量」而言，大學發表刊登之論文篇數，可作為評估大學研究成果的客觀憑據，以及探究各學門之論文篇數成長趨勢；就「質」而言，透過論文引用與被引用間的關連，描繪出論文的受重視程度，並透過期刊的影響係數(Impact Factor，以下簡稱IF)，給予學術論文進行權重判斷。